Kultivierung Chlorella Sorokeniana
08/07/2019
Nach einer erfolgreichen Kultivierung von Chlorella Vulgaris wollten wir uns nicht nur auf eine Mikroalge beschränken. Chlorella Sorokeniana ist eine vielversprechende Verwandte von Chlorella Vulgaris dementsprechend, dass Sorokeniana mehr Zucker produziert im Vergleich zu Vulgaris. Mit den Erfahrungswerten aus der Kultivierung mit Chlorella Vulgaris war es uns möglich die Chlorella Sorokeniana schnell aus einem 50 mL Falkon in den 2 L Bioreaktor zu bekommen. Unser primäres Ziel beide Algen zu kultivieren liegt hierbei darin, ein Gemisch aus beiden Algen…
Read moreErster erfolgreicher Aufschluss der Mikroalgen
24/06/2019
Durch unsere Idee Mikroalgen CO2 fixieren zu lassen und dieses zu verstoffwechseln und daraus Biopolymere erstellt, damit wir diese zur Kultivierung von Vibrio Natriegens nutzen können ergibt sich hierbei ein großes Problem. Wie kommen wir an die Zucker, Proteine etc.? Bakterien und Säugerzellen lassen sich einfach aufschließen, doch was ist mit Mikroalgen? Da bisher noch niemand mit Mikroalgen gearbeitet hat haben sich viele Ideen zum Aufschluss finden lassen. Von der Mikrowelle zum Hochdurchsatzhomogenisator bis hin zum klassischen Mörser hat nichts richtig überzeugen können, bis eine Blitzidee kam: “Da war doch was mit Autolyse, halten der Algen in saurem Milieu bei 50°C und zack man hat alle Zucker!”. Dies hat sich ebenfalls nicht ganz als die Methode der Wahl herausgestellt. Kombinationen und Versuche aller Methoden haben schlussendlich dann doch zum Erfolg geführt. Lyse mit destilliertem Wasser, pH 3 und 50°C mit einem anschließenden Aufschluss des Algenpellets mithilfe der Rührwerkskugelmühle und unser Lebenselixier Zucker war endlich frei. Nun können wir uns der Analyse des Extrakts und Bildung unseres Mediums widmen!
Read morePublished GeCoS in the Galaxy Tool Shed
25/05/2019
We developed an algorithm (written in Python) to analyse any input DNA sequence for its codon composition. GeneCodonSearch (GeCoS) can analyse whole proteomes (Coding sequences) of organisms in seconds (e.g. Escherichia coli) to minutes (e.g. Homo sapiens), depending on the hardware and the proteome size. GeCoS is publicly available in the Galaxy Tool Shed as an open-source software (https://bit.ly/2YMcRZl). We use this tool to identify naturally occurring proteins with increased contents of codons that are rarely used in Vibrio natriegens. With these…
Read moreKultivierung von Chlorella Vulgaris
06/05/2019
Zwischen erhalt der Mikroalge Chlorella Vulgaris in einem 50 mL Falcon und der Kultivierung in einem 5 Liter Bioreaktor lagen viele Hindernisse und Probleme (ca. 4 Wochen). Mit einer anfänglichen lag-Phase, wobei die Mikroalgen an unsere Laborbedingungen rangeführt werden mussten und einem Engpass in 500 mL Kulturkolben, haben sich die Mikroalgen nicht so schnell vermehrt wie erwünscht. Nach Überführung in einen 2 L Bioreaktor hat sich die erwünschte Steigerung der Vermehrungsrate ebenfalls nicht gezeigt. Erst nach Anbringung einer Begasungsanlage bei der mit Raumluft begast wird zeigte sich eine gewünschte deutlische Steigerung. So konnten die Mikroalgen sicher, steril und schnell vermehrt werden, sodass wir schlussendlich einen 5 L Bioreaktor animpfen konnten und nun…
Read moreProjekt Vorstellung in Bonn
03/05/2019
5 Delegierte unseres iGEM Teams sind nach Bonn gefahren um am iGEM spring Festival unsere Projektidee und Vorstellung vorzutragen sowie Verbindungen zu anderen iGEM Teams zu schließen. Dabei sind mehrere Kooperationen geschlossen worden, unter anderem für die Testung eines Bioreaktors mit unseren Algen!
Read moreProjekt start
03/04/2019
In-silico analyse der Codonverteilung und Nutzung von Vibrio Natriegensis
Read moreStart der Projekt Findung und Planung
06/11/2018
Nach der erfolgreichen iGEM Teilnahme im Jahr 2018, welche in einer Goldmedaille resultierte versuchen wir dieses Jahr den Erfolg zu wiederholen. Dementsprechend haben sich mit einer regen Teilnahme mehr als 15 interessierte Studierende getroffen um die Themensetzung und Teambildung zu diskutieren.
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